德国耶拿两所大学，分别是耶拿大学、德国耶拿高等专业学院。具体内容如下：

1、耶拿·弗里德里希·席勒大学（Friedrich-Schiller-Universität Jena，拉丁语为“ Alma Mater Jenensis”）简称耶拿大学（Universität Jena），始建于1558年，是德国的大学之一。为纪念德国著名诗人席勒，在1934年，耶拿大学改名为弗里德里希·席勒大学。

2、德国耶拿高等专业学院一般为耶拿应用技术大学，位于德国图林根州的耶拿市，该校建成于1991年，是一所年轻的公立大学。

补充材料：

1、耶拿大学的专业主要有：社会学、哲学、心理学、语言学、光学、经济学、物理学、生物科学、建筑设计与评估、设计与工业、食品健康学、体育科学、电信与网络工程、网络与多媒体工程、教育学、政治学、文学研究、传媒与艺术、社会科学。

2、德国耶拿高等专业学院的专业主要有：生物工程、商业管理、电气工程、自动化工程、精密仪器工程学、通讯与传媒技术、激光与光学技术、机械制造、机电一体化、医学工程、护理与护理管理、光电学与半导体技术、物理工程学、进程集成的环境保护学、社会学、应用计算机科学、材料工程、经济工程学、通用管理、科学配乐理论、社会福利工作和系统设计。