论文查重主要是通过比对文本中的内容与已有的数据库、在线资源以及其他文献进行比对，以检测文档中存在的相似性和重复性。以下是论文查重主要会检查的内容：

1. 文字相似度：论文查重工具会比对文档中的文字内容，包括论文的主体部分、引用的文献、参考资料等，以检测是否存在与已有文献或网络上的内容相同或相似的情况。

2. 语句结构和句式相似性：除了文字相似度，查重工具也会检查句子和段落的结构和句式，以发现文档中可能存在的抄袭或改写行为。

3. 引用和参考文献：查重工具还会检查文档中引用和参考的文献，以核实是否正确引用并标注参考来源。

4. 网络相似性：一些查重工具还能扫描互联网上的公开文档、学术期刊和其他机构的论文数据库，以比较文档中的内容与这些来源的相似性。

5. 自身文档相似性：有些学术机构和期刊会要求作者在投稿前进行自我查重，以确保提交的论文自身没有重复出版或重复提交的情况。

需要注意的是，使用不同的查重工具可能会有不同的检测方法和数据库覆盖范围，因此结果可能有所差异。最终，评估论文的原创性和学术诚信还需综合考虑其他因素，如引用规范、独立思考等。