论文查重判断抄袭的科学依据主要基于以下几个方面：

相似度比对：论文查重系统会将提交的论文与系统中的文献数据库进行比对，通过计算论文与数据库中文献的相似度来判断是否存在抄袭。通常，系统会设定一个相似度阈值，超过该阈值的论文会被认为存在抄袭嫌疑。这种相似度比对的方法基于文本挖掘和自然语言处理技术，可以快速、准确地检测出论文中的重复内容。语义分析：除了相似度比对，论文查重系统还会对论文进行语义分析。语义分析主要关注论文中的语义内容，而非简单的文字重复。通过语义分析，系统可以检测出论文中是否存在对他人研究成果的盗用、篡改等不当行为。这种分析方法可以更加深入地挖掘论文中的抄袭问题，提高查重的准确性。引用检测：论文查重系统还会对论文中的引用进行检测。如果论文中存在未注明出处的引用或者引用了不符合学术规范的文献，系统也会将其判定为抄袭。这种引用检测的方法有助于维护学术诚信，防止学术不端行为的发生。

总之，论文查重判断抄袭的科学依据主要基于相似度比对、语义分析和引用检测等方面。这些方法和技术手段可以共同作用，提高查重的准确性和可靠性，从而有效地维护学术诚信和学术质量。同时，学生在撰写论文时也应该遵守学术规范和道德标准，确保论文的原创性和学术价值。

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