论文查重是当前学术研究中一个极为重要的环节，特别是在教育领域，查重系统被广泛应用于毕业论文的审核中。为了确保学术诚信，各高等院校建立了毕业论文查重库，以检测学生提交的毕业论文与已发表文献之间的相似性。然而，一个亟待探讨的问题是，所有发表的论文是否都包含在毕业论文查重库中。

虽然大部分查重系统均涵盖了主流的学术期刊文献、会议论文和部分学位论文，但并不是所有已发表的论文都可以被纳入查重数据库。某些小型期刊、地方性会议论文，甚至一些尚未被数字化的老旧文献，往往被遗漏。许多教师对查重工具的信任度并不高，认为现有的数据库无法完全反映学生的原创性和学术能力。此外，教师认为查重系统必须不断更新和扩展数据库内容，以应对日益增长的文献数量，从而更有效地帮助学生提高论文质量。

目前大部分查重系统的数据库并不完全覆盖所有已发表的论文。这主要是由于各个数据库的建设和更新频率的差异，导致一些新近发布的论文未能及时纳入查重库。此外，某些学术期刊和会议论文因信息共享协议或版权限制，往往不被纳入查重系统的抓取范围。这一现象在不同领域和学科间存在一定差异，尤其在一些研究活跃的领域，新论文的更新速度与查重库的更新速度之间存在较大差距。学校应与文献发布机构建立合作关系，定期更新查重数据库，同时推动新技术的应用，例如人工智能和机器学习，来提高查重的效率和准确性。

尽管当前的查重系统在一定程度上提升了学术论文的原创性和质量，但由于已有文献的全面覆盖程度不足，导致一些高质量的研究成果未被及时发现和引用。因此，我们建议高校在使用查重系统时，应结合教师的专业判断，形成更加科学有效的评估机制。此外，针对尚未纳入查重库的文献，未来亟需采取措施促进其被包含，以进一步提升整个学术环境的公正性和可靠性。

答案并非绝对，所有发表的论文并不都包含在毕业论文查重库中。对于今后的学术研究和教育工作，扩展查重数据库的覆盖面至关重要，这不仅有助于提高毕业论文的质量，也将促进更具学术价值的研究成果的传播与使用。